Sensitive and rapid detection of two toxic microalgae Alexandrium by loop-mediated isothermal amplification     

ZHANG Fengying  SHI Yanhong  JIANG Keji  XU Zhaoli  MA Lingbo 《海洋学报(英文版)》2018,37(2):139-146

A loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay was designed and evaluated for rapid detection of the toxic microalgae Alexandrium catenella and A. minutum, which can produce paralytic shellfish poisoning (PSP). Two sets of four specific primers targeting these two species were derived from the sequence of internal transcribed spacer (ITS) of ribosomal DNA. The method worked well in less than an hour under isothermal conditions of 65℃. LAMP specificity was validated in closely related algae as a comparison, suggesting the strict specificity of the LAMP primers. Two visual inspection approaches were feasible to interpret the positive or negative results. The detection limits of A. catenella and A. minutum samples using the LAMP assay were found to be 5.6 and 4.5 pg DNA, respectively. The sensitivity of this LAMP assay was 10 or 100-fold higher than Polymerase Chain Reaction (PCR) method in detecting the two microalgae. These characteristics of species specificity, sensitivity, and rapidity suggest that this method has the potentiality in the monitoring of red tide caused by A. catenella and A. minutum.  相似文献   

海气动量通量研究综述   总被引：1，自引：0，他引：1  

冯兴如  李水清  尹宝树 《海洋科学》2018,42(10):103-109

海气界面动量通量也称为风应力,是海流和表面海浪的主要驱动力,是海洋从大气获得动量的重要途径。因此,合理可靠的海洋表面风应力的参数化对于海洋、大气和波浪以及气候模式的准确预报都具有非常重要的科学意义和实用价值。对风应力拖曳系数的参数化是风应力参数化的主要内容。近来的观测发现,风应力拖曳系数随着风速的增加出现了先增后减的趋势,同时还与海面的波浪状态以及海流有关。基于观测或理论分析,目前已经得到了一系列的风应力拖曳系数计算方法或公式,有的考虑了海浪的作用,有的没有,但这些方案大都是适合中低风速,在高风速下的适用性还有待检验。本文回顾了目前在海气动量通量观测和参数化方面的研究进展,并建议应增加高风速下风速、海流以及海浪等的同步观测,以进一步完善风应力参数化方案。  相似文献   

古元古代大氧化事件(GOE)前后海洋环境的变化: 来自华北条带状铁建造(BIF)岩相学和地球化学的证据^*          下载免费PDF全文

张连昌  兰彩云  王长乐  彭自栋  佟小雪  李文君  董志国 《古地理学报》2020,22(5):827-840

条带状铁建造(BIF)是形成于前寒武纪海洋中的化学沉积岩,记录了古海洋氧化还原状态的重要信息。华北克拉通广泛分布的新太古代和古元古代BIF,是了解古元古代大氧化事件(GOE)前后古海洋氧化还原环境变化的理想对象。初步研究表明,华北克拉通新太古代BIF主要为磁铁矿型氧化物相和硅酸盐相,极少数出现碳酸盐相;古元古代BIF包括赤铁矿型和磁铁矿型氧化物相、硅酸盐相和碳酸盐相,其中赤铁矿相是古元古代BIF独有的。以上矿物学特征表明,新太古代和古元古代水体的氧化还原条件是不同的。华北克拉通新太古代BIF的稀土元素组成缺乏强烈的负Ce异常,反映同期海水氧含量非常低,为缺氧状态; 但少量BIF也包含有负Ce异常,同时具有较大变化范围的Th/U值,指示新太古代海洋的局部水体氧含量相对较高,呈弱氧化状态。与新太古代BIF相比,古元古代BIF的Ce异常变化较大,包括无异常、正异常和负异常,尤其是赤铁矿相BIF具明显的负Ce异常,表明古元古代水体的氧含量和氧化还原结构已发生了明显变化; 结合华北克拉通BIF的Ni/Co、V/(V+Ni)和Th/U等比值特征,认为古元古代海洋呈次氧化—氧化环境。新太古代BIF 强烈富集重铁同位素,S同位素非质量分馏效应较为明显;而古元古代BIF相对富集轻铁同位素,S同位素非质量分馏效应不明显。综上,新太古代海洋环境整体缺氧,但局部可能存在氧气“绿洲”,暗示光合产氧作用在太古代晚期已经存在;大氧化事件期间及之后的古海洋总体具上部氧化、下部还原的分层特征。  相似文献   

西北太平洋上层海洋对台风响应的个例研究     

张志伟 《海洋通报》2019,38(5):562-568

基于数字台风网、欧洲中心ERA-Interim、美国国家海洋与大气局以及中国Argo实时资料中心的资料研究了西北太平洋上层海洋对台风"奥鹿"的响应。研究结果表明,当"奥鹿"移动速度在2 m/s以下时,强风应力产生的Ekman泵是上层海洋响应的主要机制,移动速度越慢,Ekman抽吸速率(EPV)越大,海表温度(SST)降温持续时间短,冷尾迹出现在台风中心位置处。当"奥鹿"移动速度达到6 m/s以上时,持续风应力驱动的惯性泵是主导机制,SST降温持续时间长,冷尾迹出现在台风路径的右侧。惯性泵比Ekman泵持续的时间长,但Ekman泵影响深度比惯性泵大得多。在"奥鹿"经过西北太平洋时,混合层深度(MLD)变浅并伴随着"冷抽吸"作用的出现。上层海洋中"冷抽吸"现象较"热泵"现象影响深度深,持续时间长,在"奥鹿"过境后可持续20天以上。  相似文献   

Estimating the starting time and identifying the type of urbanization based on dense time series of landsat-derived Vegetation-Impervious-Soil (V-I-S) maps – A case study of North Taiwan from 1990 to 2015     

《International Journal of Applied Earth Observation and Geoinformation》2020

Land cover and land use change (LCLUC) is a global phenomenon, and LCLUC in urbanizing regions has substantial impacts on humans and their environments. In this paper, a semi-automatic approach to identifying the type and starting time of urbanization was developed and tested based on dense time series of Vegetation-Impervious-Soil (V-I-S) maps derived from Landsat surface reflectance imagery. The accuracy of modeled V-I-S fractions and the estimated time of initial change in impervious cover were assessed. North Taiwan, one of the regions of the island of Taiwan that experienced the greatest urban LCLUC, was chosen as a test area, and the study period is 1990 to 2015, a period of substantial urbanization. In total, 295 dates of Landsat imagery were used to create 295 V-I-S fraction maps that were used to construct fractional cover time series for each pixel. Root Mean Square Error (RMSE)s for the modeled Vegetation, Impervious, and Soil were 25 %, 22 %, 24 % respectively. The time of Urban Expansion is estimated by logistic regression applied to Impervious cover time series, while the time of change for Urban Renewal is determined by the period of brief Soil exposure. The identified location and estimated time for newly urbanized lands were generally accurate, with 80% of Urban Expansion estimated within ±2.4 years. However, the accuracy of identified Urban Renewal was relatively low. Our approach to identifying Urban Expansion with dense time series of Landsat imagery is shown to be reliable, while Urban Renewal identification is not.  相似文献   

基于移动三维扫描技术的隧道管片错台分析及应用     

赵亚波  王智 《测绘通报》2020,(8):160-163

错台是地铁隧道的主要病害之一，通常是由于盾构机施工控制不好或是隧道荷载发生变化导致，错台的发生也会引起隧道收敛变形及渗水等其他病害。传统手段主要采用人工巡检等方式进行错台情况的检测，由于受夜间窗口期短的影响，该方法效率低，成果难以精确量化。研究采用基于轨道的隧道移动三维激光扫描系统对隧道错台进行检测，通过快速获取隧道三维点云生成正射影像，并基于正射影像进行管片的划分及里程的匹配，进而根据每一环的三维点云信息计算管片错台情况。以青岛地铁2号线为例，本文介绍了移动扫描技术在地铁隧道管片错台检测的应用情况，为该技术在其他隧道的推广应用提供了一定的借鉴意义。  相似文献   

复杂环境下地基SAR粗差探测及应用     

马金玉  龙四春  童爱霞  吴文豪  祝传广 《测绘通报》2020,(2):43

雷达视线受施工机械等的间断遮挡导致部分影像产生相位奇异值，从而造成解缠错误及误差传递，简单的相关影像处理难以识别受遮挡影像。本文提出了改进的基于小波变换的信号奇异性检测方法，通过对地基SAR PS点时序相位特征进行分析，将遮挡影像识别转化为粗差探测问题；由PS点相位序列与影像位置关系，根据测区PS点相位序列的奇异点集合得到受遮挡影像集；最后将受遮挡影像剔除后得到的地基SAR监测结果与精密全站仪、水准与游标卡尺数据进行对比分析。结果表明：本文提出的方法用于受遮挡影像的识别是可行的，解决了地基SAR在实际工程应用中可能存在的影像遮挡带来的测量数据含有粗差的问题，提高了监测区域伪影像检测的效率与准确性。  相似文献   

基于深度学习的目标检测定位系统设计与实现     

王俊强  李建胜  程相博  杨戬峰 《测绘与空间地理信息》2020,(1):133-136,144

针对传统遥感影像目标检测方法效率不高,并且无有效手段对检测信息进行管理利用的问题,提出了在B/S构架下基于深度学习的目标检测及定位方法。通过集成深度学习框架、WebGIS以及数据库,实现了集遥感影像目标检测、展示及管理于一体的目标检测定位系统,满足多用户基于前端浏览器的并发目标检测需求。利用网格划分策略,实现了基于前端的大区域范围的目标快速检测。基于某机场飞机目标及某城市区域运动场目标检测结果表明:本文设计的目标检测定位系统能够在前端实现目标快速检测定位,具有较高检测精度,并可有效管理检测信息,为深度学习循环再利用提供数据支撑。  相似文献   

经济海藻病害及防控技术的研究进展     

杨慧超  李杰  阎永伟  唐磊  茅云翔  莫照兰 《海洋科学》2019,43(1):101-111

经济海藻的病害一直是海藻人工栽培的一大障碍,往往造成严重的经济损失。目前对藻类病害的研究大多集中于病原鉴定,而病原的多样性和复杂的海区微环境增加了病原分离和鉴定的难度。本文综述了经济海藻病害发生的原因、病原的多样性和致病机制、病原的鉴定、检测和防治方法,并对未来我国海藻病害研究方向进行了展望,以期对藻类病害的防控提供参考。  相似文献   

基于多源信息融合的浅海超低频声源目标探测关键技术及实现     

孙显彬  郑轶  于非 《海洋科学》2019,43(1):95-100

以多传感器信息融合理论为指导,结合现代信息处理技术与数据驱动建模及科学计算技术,研究浅海超低频声源目标激发共存地震波的复合声场中超低频声波传播特性和数据驱动建模的水下目标深度识别等关键技术,并论证了技术实现方案及路径。结果表明:以复合矢量水听器、地震波监测仪等多传感器信息融合理论为指导研究前海超低频声源目标可以克服传统声场建模存在的问题,有助于浅海超低频声源目标探测及改善海洋水下声学监测手段。在提高声呐探测设备的测量准确度、精度方面具有重要的理论意义,对周边海域为浅海的我国海防具有实战价值。  相似文献